بررسی تنوع ژنتیکی شگ ماهی خزری-Alosa braschnikowi broodine,1904- در سواحل جنوبی ... |
فهرست مطالب
عنوان صفحه
1- مقدمه. 2
1-1- کلیات… 2
2-1- ردهبندی.. 2
3-1- خصوصیات کلیدی.. 3
4-1- پراکنش و تخمریزی.. 3
5-1- زیستگاه 3
6-1- سن و رشد. 3
7-1- غذا 4
8-1- ذخیره 4
9-1- مطالعه فرا جمعیتها 5
10-1- تنوع ژنتیکی و کمی کردن آن. 6
11-1- عوامل مؤثر بر تنوع ژنتیکی.. 6
1-11-1- رانش ژنتیکی.. 7
2-11-1- گردنه بطری.. 7
3-11-1- انتخاب طبیعی.. 8
4-11-1- روش تولید مثل.. 8
12-1- انواع نشانگرهای ژنتیکی.. 8
1-12-1- نشانگرهای مورفولوژیکی.. 9
2-12-1- نشانگرهای پروتئینی.. 9
3-12-1- نشانگرهای مولکولی DNA و RNA.. 10
13-1- سنجش فراوانی آللی.. 13
14-1- تغییر فراوانی آللی.. 14
15-1- موازنه هاردی- واینبرگ و دلایل انحراف از آن. 14
فهرست مطالب
عنوان صفحه
16-1- آماره F. 16
17-1- فاصله ژنتیکی (Nei, 1978) 17
18-1- ضرورت تحقیق.. 18
19-1- اهداف… 19
20-1- فرضیهها 20
1-2- مروری بر مطالعات انجام شده در داخل کشور. 22
2-2- مروری بر مطالعات انجام شده در خارج از کشور. 24
3- مواد و روشها 30
1-3- نمونهبرداری.. 30
2-3- استخراج DNA.. 31
3-3- نحوه استخراج DNA.. 33
4-3- مراحل استخراج DNA.. 33
5-3- ارزیابی کیفیت و کمیت DNA استخراج شده 34
6-3- ارزیابی کیفیت DNA با استفاده از الکتروفورز افقی ژل آگارز یک درصد. 36
7-3- واکنش زنجیرهای پلیمراز. 37
1-7-3- انجام واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) 37
8-3- بهینهسازی PCR.. 38
9-3- الکتروفورز محصول PCR، با استفاده از ژل پلی آکریل آمید 6%. 38
10-3- روش تهیه ژل آكریل آمید. 39
11-3- رنگ آمیزی ژل پلی آکریل آمید با روش نیترات نقره 40
12-3- ثبت تصاویر. 40
13-3- آنالیز آماری.. 41
فهرست مطالب
عنوان صفحه
4- نتایج.. 44
1-4- نتایج حاصل از بررسی کیفیت و کمیت DNA استخراجی از شگماهی براشنیکوی در مطالعه حاضر 44
یک مطلب دیگر :
2-4- نتایج حاصل از واکنش زنجیرهای پلیمراز. 45
3-4- فراوانی و تعداد آللها 47
4-4- تعداد آللهای واقعی (Na) و مؤثر (Ne) 50
5-4- تنوع ژنتیکی.. 51
6-4- شاخص شانون. 52
7-4- تعادل هاردی- واینبرگ… 53
8-4- نتایج آزمون واریانس مولکولی (AMOVA) 54
9-4- شباهت و فاصله ژنتیکی بر اساس شاخص نئی (Nei Index) 56
5- بحث… 60
1-5- مطالعات تعداد نمونه، روش استخراج DNA و انتخاب نشانگرها 60
2-5- مطالعات تنوع ژنتیکی.. 61
3-5- مطالعات مربوط به تعادل هاردی- واینبرگ… 65
4-5- مطالعات مربوط به تمایز جمعیتی.. 67
5-5- مطالعات مربوط به شباهت و فاصله ژنتیکی.. 68
6-5- نتیجهگیری کلی.. 69
7-5- پیشنهادات اجرایی.. 69
8-5- پیشنهادات پژوهشی.. 70
فهرست منابع. 72
فهرست جدولها
عنوان صفحه
جدول 1-4- جایگاههای ژنی مورد استفاده در این مطالعه و خصوصیات آنها 45
جدول 2-4- نتایج حاصل از ظرفیت اطلاعات چند شکلی (PIC) نشانگرهای مورد استفاده در مطالعه حاضر 45
جدول 3-4- تعداد و وزن آللهای بهدست آمده بر حسب bp در سطح شش جایگاه ژنی مورد استفاده در این مطالعه 48
جدول 4-4- فراوانی آللی مشاهده شده در سطح جایگاههای ژنی مورد مطالعه در این تحقیق.. 49
جدول 5-4- تعداد آللهای واقعی (Na) و مؤثر (Ne) در سطح جایگاههای ژنی مورد بررسی در پنج منطقه پراکنش شگماهی براشنیکووی (A. braschnikowi) 50
جدول 6-4- مقادیر هتروزیگوسیتی مشاهده شده (Ho) و مورد انتظار (He) جمعیتهای مورد مطالعه در ماهی A. braschnikowi در سطح جایگاههای ژنی مورد بررسی.. 51
جدول 7-4- میانگین مقادیر هتروزیگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار ±خطای استاندار در مناطق مورد مطالعه از ماهی A. braschnikowi 52
جدول 8-4- مقادیر محاسبه شده شاخص شانون برای مناطق مورد بررسی در ماهی A. braschnikowi در سطح جایگاهها 52
جدول 9-4-مقادیر محاسبه شده در بررسی تعادل هاردی- واینبرگ در مناطق مورد بررسی در شش جایگاه ژنی 53
جدول 10-4- آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) تحت معیار Fst 54
جدول 11-4- آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) تحت معیار Rst 54
جدول 12-4- مقادیر Fst محاسبه شده بین مناطق بر اساس آنالیز واریانس مولکولی.. 55
جدول 13-4- مقادیر Rst محاسبه شده بین مناطق بر اساس آنالیز واریانس مولکولی.. 55
جدول 14-4- مقادیر بهدستآمده از ضرایب تمایز (Fst) و درونآمیزی (Fis) در سطح جایگاههای ژنی مختلف در مطالعه حاضر 55
فهرست جدولها
عنوان صفحه
جدول 15-4- مقادیـر جریـان ژنـی (Nm) مشـاهده شـده بین مناطـق مورد بررسی در ماهی A. braschnikowi 56
جدول 16-4- ماتریکس فاصله و شباهت ژنتیکی بر اساس شاخص نئی (نئی، 1972) 56
جدول 17-4- خلاصهای از نتایج تخصیص جمعیتها به خود و دیگر مناطق.. 57
فهرست شكلها
عنوان صفحه
شکل 1-3- نقشه مناطق نمونه برداری ماهی A. braschnikowi در سواحل جنوبی دریای خزر در مطالعه حاضر 30
فرم در حال بارگذاری ...
[پنجشنبه 1399-08-08] [ 07:45:00 ق.ظ ]
|