کلونینگ و بیان فاکتور محرک رشد کلنی گرانولوسیتی(GCSF) نوترکیب در مخمر Hansenula Polymorpha |
انتقال وکتورهای بیانی به هانسونلا پلی مورفا…………………………………………………………………………12
جداسازی سویه های نوترکیب…………………………………………………………………………………………….12
تنظیم متابولیسم متانول……………………………………………………………………………………………………….12
فاکتور محرک رشد کلنی (G-CSF)…………………………………………………………………………………….13
ژن gcsf………………………………………………………………………………………………………………………….13
پروتئین GCSF………………………………………………………………………………………………………………..13
عملکرد پروتئین GCSF…………………………………………………………………………………………………….14
فصل دوم مواد و روش ها
میکروارگانیسم های مورد استفاده………………………………………………………………………………………..17
محیط های کشت مورد نیاز………………………………………………………………………………………………..17
پلاسمیدهای مورد استفاده…………………………………………………………………………………………………..18
آنزیم ها و کیت ها……………………………………………………………………………………………………………18
آنتی بیوتیک ها…………………………………………………………………………………………………………………18
الکتروفورز افقی محصول PCR و یا نمونه DNA بر روی ژل آگارز………………………………………….19
تخلیص محصول هضم آنزیمی با استفاده از کیت تخلیص از ژل آگارز……………………………………..19
واکنش لیگاسیون قطعات تخلیص شده…………………………………………………………………………………20
تهیه سلول های مستعد ‘E. coli TOP10F به روش تیمار با کلرید کلسیم…………………………………..20
انتقال پلاسمید به سلول های مستعد……………………………………………………………………………………..21
بررسی کلونهای نوترکیب به روش سریع………………………………………………………………………………21
PCR بر روی کلنی های باکتریایی/مخمری…………………………………………………………………………..22
استخراج پلاسمید در مقیاس کم………………………………………………………………………………………….22
استخراج پلاسمید در مقیاس زیاد………………………………………………………………………………………..23
الکتروفورز پروتئین بر روی ژل پلی اکریل آمید(SDS-PAGE)………………………………………………..24
سنتز ژن gcsf…………………………………………………………………………………………………………………..29
PCR اختصاصی بر روی ژن gcsf……………………………………………………………………………………….30
کلون نمودن ژن gcsf در وکتور بیانی هانسونلا………………………………………………………………………31
هضم آنزیمی وکتور pGH-gcsf………………………………………………………………………………………….32
هضم آنزیمی وکتوربیانی pHan…………………………………………………………………………………………33
کلون نمودن قطعه gcsf در وکتور بیانی pHan………………………………………………………………………33
بررسی کلون های نوترکیب pHan-gcsf……………………………………………………………………………….34
هضم آنزیمی وکتور pHan-gcsf…………………………………………………………………………………………35
کلون نمودن ژن مقاومت به زئوسین در وکتور بیانی pHan-gcsf……………………………………………..35
PCR اختصاصی بر روی ژن مقاومت به زئوسین……………………………………………………………………35
کلون نمودن ژن zeocin در وکتور کلونینگ pGEM-T Easy………………………………………………….37
بررسی کلون های نوترکیب pGEM-zeo……………………………………………………………………………..38
کلون نمودن ژن مقاومت به زئوسین در وکتور بیانی pHan-gcsf………………………………………………39
هضم آنزیمی وکتور pHan-gcsf و pGEM-zeo……………………………………………………………………39
کلون نمودن ژن مقاومت به زئوسین در وکتور بیانی تیمار شده با آلکالین فسفاتاز pHan-gcsf………40
یک مطلب دیگر :
بررسی کلونهای نوترکیب pHan-gcsf-zeocin………………………………………………………………………41
انتقال پلاسمید نوترکیب pHan-gcsf-zeocin به سلول هانسونلا پلی مورفا…………………………………41
هضم آنزیمی وکتور بیانی pHan-gcsf-zeocin………………………………………………………………………41
الکتروپوریشن سلول های هانسونلا پلی مورفا………………………………………………………………………..42
تأیید کلونهای نوترکیب هانسونلا با روش Colony PCR اختصاصی ژن زئوسین………………………..43
بیان پروتئینGCSF در هانسونلا پلی مورفا…………………………………………………………………………..44
کشت سلولهای مخمری……………………………………………………………………………………………………..44
بررسی بیان پروتئین نوترکیب با روش SDS-PAGE………………………………………………………………44
تزریق نمونه پروتئینی به خرگوش………………………………………………………………………………………..45
ایمونوبلاتینگ…………………………………………………………………………………………………………………..46
فصل سوم نتایج
سنتز ژن gcsf…………………………………………………………………………………………………………………..49
PCR اختصاصی بر روی ژن gcsf………………………………………………………………………………………49
طراحی پرایمر های اختصاصی ژن gcsf……………………………………………………………………………….49
بهینه سازی واکنش PCR برای ژن gcsf……………………………………………………………………………….50
کلون نمودن ژن gcsf در وکتور بیانی هانسونلا………………………………………………………………………51
هضم آنزیمی وکتور کلونینگ pGH-gcsf و وکتور بیانی pHan……………………………………………….51
بررسی کلونهای نوترکیب pHan-gcsf…………………………………………………………………………………52
بررسی کلونها به روش سریع……………………………………………………………………………………………..52
انجام PCR ژن gcsf بر روی پلاسمید نوترکیب pHan-gcsf……………………………………………………52
هضم آنزیمی وکتور تأیید شده pHan-gcsf…………………………………………………………………………..53
کلون نمودن ژن مقاومت به زئوسین در وکتور بیانی pHan-gcsf……………………………………………..54
PCR اختصاصی بر روی ژن مقاومت به زئوسین (Sh ble)…………………………………………………….54
کلون نمودن ژن zeocin در وکتور کلونینگ pGEM-T Easy………………………………………………….55
تأیید کلون های نوترکیب pGEM-zeocin……………………………………………………………………………55
بررسی سریع کلونهای نوترکیب…………………………………………………………………………………………..55
هضم آنزیمی پلاسمید نوترکیب pGEM-zeo با BglII……………………………………………………………56
کلون نمودن ژن مقاومت به زئوسین در وکتور بیانی pHan-gcsf………………………………………………57
بررسی کلونهای نوترکیب pHan-gcsf-zeocin……………………………………………………………………57
بررسی سریع کلونهای نوترکیب…………………………………………………………………………………………..57
بررسی کلونها به روش Colony-PCR…………………………………………………………………………………58
برش آنزیمی وکتور نوترکیب pHan-gcsf-zeo………………………………………………………………………58
انتقال پلاسمید نوترکیب pHan-gcsf-zeocin به سلول هانسونلا پلی مورفا…………………………………59
هضم آنزیمی وکتور بیانی pHan-gcsf-zeocin و انتقال به سلول هانسونلا………………………………….59
تأیید کلونهای نوترکیب هانسونلا با روش Colony-PCR ژن زئوسین……………………………………….59
بیان پروتئینGCSF در هانسونلا پلی مورفا………………………………………………………………………….60
تأیید پروتئین نوترکیب تولید شده با روش Immuno-Blotting……………………………………………….61
فصل چهارم :بحث و پیشنهادات
رویکرد کلی پژوهش…………………………………………………………………………………………………………63
فصل پنجم : منابع و پیوست
فرم در حال بارگذاری ...
[پنجشنبه 1399-08-01] [ 06:13:00 ب.ظ ]
|