1-11-ویژگیهای مورد بررسی در طبقهبندی سیاهکها.. 7
1-11-1- گیاه میزبان. 7
1-11-2- علائم بیماری. 7
1-11-3- ریختشناسی. 8
1-11-3-1- پیوستگی اسپورها. 8
1-11-3-2- اسپورها. 10
1-11-3-3- غلاف. 12
1-11-3-4- سلولهای نازا. 12
1-11-3-5- اسپورهای نارس. 12
1-11-3-6- تندش اسپور. 12
1-12-پراکنش جغرافیایی……………………………………………………………………………………………………………………………..14
1-13-مراحل آلوده سازی میزبان توسط قارچ های مولد سیاهک. 14
هشت
1-14-طبقهبندی سیاهک ها. 14
1-15-شناسایی مولکولی.. 19
1-16-اهداف طرح. 22
فصل دوم:مواد و روش ها. 24
2-1- موقعیت جغرافیایی استان مرکزی و لرستان. 24
2-2- نمونهبرداری.. 25
2-3- تهیه نمونههای هرباریومی. 29
2-4- روش بررسی و شناسایی نمونهها. 30
2-4-1- تهیه نمونههای میکروسکوپی.. 30
2-4-2- بررسی نحوه جوانهزنی تلیوسپورها. 31
2-5- استخراج DNA.. 32
2-5-1- استخراج DNA به روش موری و تامسون (1980).. 32
2-5-2- استخراج DNA به روش تغییر یافته شارما و همکاران (2002). 33
2-5-3- استخراج DNA به روش ردر و برودا (1985).. 34
2-6- بررسی کمیت و کیفیت DNA.. 35
2-6-1- تعیین کمیت و کیفیت DNA با استفاده از ژل آگارز.. 36
2-6-2- روش اسپکتروفتومتری. 36
2-7- واکنش PCR.. 37
2-7-1- آغازگرهای اختصاصی. 37
2-7-2- مخلوط نوکلئوتیدی dNTPs 38
2-7-3- کلرید منیزیم. 38
2-7-4- بافر PCR.. 38
2-7-5- آنزیم Taq DNA پلیمراز.. 38
2-7-6 – مخلوط Taq DNA Polymerase Master mix. 39
2-8-تنظیم شرایط واکنش PCR.. 39
2-9- الکتروفورز محصولات PCR.. 41
نه
2-10- تعیین توالی نوکلئوتیدی. 42
فصل سوم: نتایج وبحث. 44
3-1- توصیف جنس Sporisorium.. 44
3-1-1- گونه Sporisorium cruentum.. 45
3-1-1-2- میزبانها. 45
3-1-1- 3- نمونه های بررسی شده. 45
3-1-1-4- علائم. 45
3-1-1-5- شرح گونه. 46
3-1-2- گونه ………….………………….………………………… Sporisorium reilianum…48
3-1-2-1- میزبانها. 48
3-1-2-2- نمونههای بررسی شده. 48
3-1-2-3- علائم. 48
3-1-2-4- شرح گونه. 49
3-2- جنس Ustilago. 51
3-2-1- گونهUstilago avenae 51
3-2-1-1- میزبانها. 52
3-2-1-2- نمونههای مورد بررسی. 52
3-2-1-3- علائم. 52
3-2-1-4- شرح گونه. 52
3-2-2- گونه Ustilago bromivora 54
3-2-2-1- میزبانها. 55
3-2-2-2- نمونه های بررسی شده. 55
3-2-2-3- علائم. 55
3-2-2-4- شرح گونه. 56
3-2-3- گونه Ustilago cynodontis 57
3-2-3-1- میزبان. 58
ده
3-2-3-2- نمونههای بررسی شده. 58
3-2-3-3- علائم. 58
3-2-3-4- شرح گونه. 58
3-2-4- گونه Ustilago hordei 60
3-2-4-1- میزبانها. 60
3-2-4-2- نمونههای مورد بررسی شده. 61
3-2-4-3- علائم. 61
3-2-4-4- شرح گونه. 61
3-2-5- گونه Ustilago maydis 63
3-2-5-1- میزبانها. 63
3-2-5-2- نمونههای مورد بررسی شده. 63
3-2-5-3- علائم. 64
3-2-5-4- شرح گونه. 64
3-2-6- گونه Ustilago nuda 66
3-2-6-1- میزبانها. 66
3-2-6-2- نمونههای بررسی شده. 66
3-2-6-3- علائم. 66
3-2-6-4- شرح گونه. 66
3-2-6- گونهUstilago tritici 68
3-2-6-1- میزبانها. 69
3-2-6-2- نمونههای بررسی شده. 69
3-2-6-3- علائم. 69
3-2-6-4- شرح گونه. 70
3-2-7- گونهUstilago turcomanica 72
3-2-7-1- میزبانها. 72
3-2-7-2- نمونههای بررسی شده. 73
یازده
3-2-7-3- علائم. 73
3-2-7-4- شرح گونه . 73
3-3- جنس Tilletia. 75
3-3-1- گونه Tilletia controversa 76
3-3-1-1- میزبانها. 76
3-3-1-2- نمونههای بررسی شده.. 77
3-3-1-3- علائم. 77
3-3-1-4- شرح گونه. 77
3-3-2- گونهTilletia laevis 79
3-3-2-1- میزبانها. 79
3-3-2-2- نمونههای بررسی شده.. 80
3-3-2-3- علائم. 80
3-3-2-4- شرح گونه. 80
یک مطلب دیگر :
3-4- کلید شناسایی جنسهای قارچهای Ustilaginales عامل سیاهک، جمعآوری شده از استان مرکزی و لرستان:. 82
3-4-2- کلید شناسایی گونههای Ustilago. 82
3-4-3- کلید شناسایی گونههای Tilletia. 84
3-5- بررسی مولکولی. 84
3-5-1- استخراج DNA.. 84
3-5-2- شناسایی گونههای Ustilago tritici، U.nuda و U.hordei با استفاده از واکنش PCR 86
3-6- بررسی توالیهای مورد نظر با استفاده از جستجوگر BLAST.. 87
3-7- مقایسه فیلوژنتیکی توالیهای بدست آمده. 90
3-7-1- مقایسه توالی نوکلئوتیدی جدایههای توالییابی شده U. tritici (LO42)، گونه U. nuda (LO43) و U. hordei (Ar7) با گونههای موجود در بانک ژن با جفت آغازگر ITS5-F/ITS4-R 90
3-7-2- مقایسه توالی نوکلئوتیدی جدایههای توالییابی شده U. tritici (LO42)، U. nuda (LO43)، U. hordei (Ar7) با جدایههای موجود در بانک ژن با جفت آغازگر rpb1. 91
3-7-3- مقایسه توالی نوکلئوتیدی گونههای توالییابی شده U. tritici (LO42)، U. nuda (LO43)، U. hordei (Ar7) با گونههای موجود در بانک ژن با جفت آغازگر β- tubulin. 92
دوازده
فصل چهارم: نتیجهگیری کلی و پیشنهادها. 96
4-1- نتیجهگیری کلی. 96
4-2- پیشنهادها. 98
منابع. 106
سیزده |
فهرست اشکال
عنوان صفحه
شکل1-1- شمای چرخه زندگی سیاهکها.. 6
شکل1-2- اسپورهای منفرد یا تکی در گونه های جنس Tilletia. 9
شکل1-3- توپ اسپورهای متشکل شده از اسپورهای زایا و عقیم در گونههای Urocystis 9
شکل 1-4 – انواع تزیینات رویه اسپور سیاهکها.. 11
شکل 1-5- انواع تیپهای تندش اسپور سیاهکها. تیپ Ustilago (A)، Tilletia (B)، Yenia ©، Pericladium (D)، Anthracoidea (E)، Glomosporium (F) 13
شکل3-1- سورهای Sporisorium cruentumروی گیاه .Sorghum halepense. 46
شکل 3-2- اسپورهای زایا و نازا .Sporisorium cruentum.. 47
شکل 3-3- تصویر میکروسکوپی فلورسنت اسپور .Sporisorium cruentum.. 47
شکل 3-4- جوانه زنی Sporisorium cruentum و تشکیل بازیدیوم و بازیدیوسپورها. 47
شکل3-5- سورهای Sporisorium reilianum روی.Sorghum halepense L. 49
شکل 3-6- اسپورهای زایا و نازا .Sporisorium reilianum.. 50
شکل3-7- تصویر میکروسکوپی فلورسنت اسپورهای نازا (الف) و زایا (ب) .Sporisorium reilianum.. 50
شکل 3-8- جوانهزنی Sporisorium reilianum و تشکیل بازیدیوم و بازیدیوسپورها. 50
شکل 3-9- سورهای Ustilago avenae روی گیاه .Avena fatua L. 53
شکل 3-10- اسپورهای .Ustilago avenae. 53
شکل 3-11- تصویر میکروسکوپی فلورسنت اسپور .Ustilago avenae. 54
شکل 3-12- جوانه زنی Ustilago avenae و تشکیل بازیدیوم و بازیدیوسپورها. 54
شکل 3-13- اسپورهای Ustilago bromovoria روی گیاه Bromus tectorum L. 56
شکل 3-14- اسپورهای .Ustilago bromovoria. 56
شکل 3-15- تصویر میکروسکوپی فلورسنت اسپور.Ustilago bromovoria. 57
شکل 3-16- جوانهزنی Ustilago bromovoria و تشکیل بازیدیوم و بازیدیوسپورها. 57
چهارده
[پنجشنبه 1399-08-08] [ 04:54:00 ب.ظ ]
|