1-12-3-1- نشانگرهای غیر مبتنی برPCR ——- 15
1-12-3-2- نشانگرهای مبتنی برPCR ———- 16
1-12-3-2-1 نشانگرPAPD ———– 17
1-12-3-2-2 نشانگرAFLP ———— 17
1-12-3-2-3 نشانگرSSR ————- 17
1-12-3-2-4 نشانگرISSR ———— 18
1-12-3-2-5 نشانگرSRAP و مزایا و معایب آنبلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد————- 19
- کاربرد نشانگر(مارکر)هایDNA — 20
- واکنش زنجیرهای پلیمراز(PCR)—- 21
1-14-1- مراحل واکنش زنجیرهای پلیمراز————- 22
- تجزیه و تحلیل دادهها———— 24
1-15-1 دندروگرام————- 24
1-15-2 تجزیه خوشه ای——— 25
1-15-3 ضریب شباهت———- 26
1-15-4 انتخاب الگوریتم——— 26
- بررسی كارآیی الگوریتم مورد استفاده در تجزیه كلاستر—– 26
- شاخص شانون-بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد 27
- بررسی تنوع و تفاوت ژنتیکی بین جمعیتها براساس آنالیز Neiبلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد————– 27
- سابقه تحقیق-بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد– 28
1-15-1- مروری بر برخی پژوهشهای انجام شده بر روی Quercus brantii Lindl.———— 28
1-15-2- مروری بر برخی پژوهشهای انجام شده با استفاده از نشانگرSRAPبلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد– 28
فصل دوم: مواد و روشها
2-1- انتخاب مناطق و جمعیتها— 33
2-2- جمعآوری نمونه ها و آماده سازی آنها 34
2-3- استخراج DNA از نمونه های گیاهی- 34
2-3-1- آماده کردن نمونه ها 34
2-3-2- استخراج DNA– 35
2-3-2-1- مواد موردنیاز 35
2-3-2-2- روش کار- 36
2-4- تعیین كیفیت وكمیت DNA– 37
2-5- واكنش زنجیره ای پلیمراز) (PCR– 39
2-6- الکتروفورز- 41
2-6-1- محلول اتیدیوم بروماید- 42
2-6-2- تهیه ژل الکتروفورز- 43
2-6-3- الکتروفورز محصول PCR– 43
2-7- تجزیه و تحلیل داده ها 44
فصل سوم: نتایج و بحث
3-1پلیمورفیسم -بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد——- 46
3-2 بررسی پارامترهای اصلی تنوع ژنتیکی همه لوکوسها در جمعیتهای گونهQuercus brantii Lindl.——- 50
3-3 بررسی تنوع و تفاوت ژنتیکی بین جمعیتها براساس آنالیز Nei—- 52
یک مطلب دیگر :
3-4 شباهت و فاصله ژنتیکی بین 5 جمعیت—– 54
3-5 بحث و نتیجهگیری کلی—————- 55
3-6 پیشنهادات-بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد——– 59
منابع– 62
فهرست شکلها
شکل1- 1 پراکندگی جهانی جنس بلوط (Quercus)————- 6
شکل 1-2 پراکندگی جنس بلوط(Quercus) در ایران———— 7
شکل 1-3 نمایی از گونه Quercus brantii Lindl.———— 10
شکل 1-4 نحوه اتصال پرایمرهای forward و reverse به DNA الگوبلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد————– 20
شکل 1-5 واکنش زنجیرهای پلیمراز——— 24
شکل2- 1 جمعیتها و مناطق بررسی شده در این تحقیق———– 33
شکل2-2 نمونههای برگ تازه در آزمایشگاه—– 34
شکل 2-3 دستگاه اسپکتروفتومتر برای تعیین کمیت DNA——– 38
شکل 2-4 دستگاه ترموسایکلر————- 41
شکل 2-5 دستگاه الکتروفورز عمودی——– 42
شکل 2-6 ساختار اتیدیوم برماید———– 42
شکل 2-7 دستگاه ژل داک—————- 43
شکل 3-1 الگوی باندی پرایمر————– 46
شکل 3-2 دندروگرام ژنوتیپ های مورد بررسی– 55
فهرست جداول:
جدول 2-1 اسامی جمعیتها و مناطق بررسی شده در این تحقیق—- 33
جدول 2-2 مواد استفاده شده در PCR—— 39
جدول 2-3 برنامهPCR -بلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد 40
جدول 2-4 پرایمرهای مورداستفاده در آزمایش- 40
جدول 3-1 نتایج کدگذاری آغازگر Me2-Em2 برای همهی جمعیتهابلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد————– 47
جدول 3-2 نتایج چندشکلی پرایمرهای استفاده شده در این تحقیق— 49
جدول 3-3 پارامترهای تنوع ژنتیکی همه لوکوسها در کل نمونهها بر اساس مارکر SRAPبلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد———- 51
جدول 3-4 شاخصهای تنوع بین جمعیتی HT، HS، GST و Nem در جمعیتهای Q. brantii————— 53
جدول 3-5 جدول ماتریس تشابه بدست آمده برای نشانگر SRAP در بین جمعیتهابلافاصله پس از پرداخت لینک دانلود فایل در اختیار شما قرار می گیرد—– 54
چکیده
بلوط (Quercus) یکی از مهمترین جنسهای چوبی نیمکره شمالی است. این جنس از اصلیترین گونههای درختی ایران به شمار میرود. تاکسونومی و ارتباط تکاملی جمعیتهای بلوط ایرانی بر اساس مارکرهای مولکولی به طور گستردهای مطالعه نشده است. در این مطالعه، ارتباط ژنتیکی جمعیتهای بلوط با به کارگیری مارکر SRAP امتحان شد. پنج جمعیت بلوط از مناطق مختلف زاگرس شامل یاسوج، برمدشت، بیستون، آبدانان و خوزستان جمعآوری و آنالیز شدند. یازده جفت پرایمر SRAP در کل نمونهها 32 باند از 100 تا 400bp ایجاد کردند. 27 تا از این باندها پلیمورف بودند و درصد پلیمورفیسم38/84% به دست آمد. ضریب تشابه نی محاسبه شد و دندروگرام بر اساس UPGMA از روی دادههای SRAP ترسیم شد. دادههای SRAP با به کارگیری نرمافزار popgene در چهار خوشه دستهبندی شد. آنالیز ژنتیکی دامنه تشابه ژنتیکی بین جمعیتی نسبتاً بالا از حداقل 8818/0 بین یاسوج و برمدشت تا حداکثر 9587/0 بین بیستون و آبدانان را نشان داد. جمعیتهای مطالعه شده بلوط تنوع بالایی را نشان دادند: شمار آلل موثر 46/1 بود و شاخص تنوع ژنتیکی شانون (I) به طور متوسط 69/41% بود. جمعیتهای امتحان شده اختلاف ژنتیکی بین جمعیتی نسبتاً بالایی را (2/0 GST=) نشان دادند و جریان ژنی(Nem) 96/1 بود.
واژههای کلیدی: بلوط، تنوع ژنتیکی، مارکر مولکولی SRAP، نی، پلیمورفیسم
فصل اول:
[جمعه 1399-08-02] [ 12:16:00 ق.ظ ]
|