ژنوتایپینگ سویه های سالمونلا انتریکا سرووار انتریتیدیس جدا شده از نمونه های بالینی ...

استاد راهنما:

دکتر رضا رنجبر

سال تحصیلی : 1393

برای رعایت حریم خصوصی نام نگارنده پایان نامه درج نمی شود

(در فایل دانلودی نام نویسنده موجود است)

تکه هایی از متن پایان نامه به عنوان نمونه :

(ممکن است هنگام انتقال از فایل اصلی به داخل سایت بعضی متون به هم بریزد یا بعضی نمادها و اشکال درج نشود ولی در فایل دانلودی همه چیز مرتب و کامل است)

فهرست مطالب

عنوان صفحه

چکیده فارسی 1

فصل اول :کلیات تحقیق 2

بیان مسئله 3

1-2- کلیات 5

1-2-1، تاریخچه 5

1-2-2، باکتریولوژی سالمونلا 6

1-2-3، تست ها و خواص بیوشیمیایی 6

1-2-4، طبقه بندی سالمونلا 7

1-2-5، آنتی ژن های سالمونلا 9

1-2-6، عوامل دخیل در بیماریزایی در سالمونلا 12

1-2-7. بیماری های ناشی از سالمونلا 13

1-2-8. اپیدمیولوژی سالمونلا 16

1-2-9، تشخیص آزمایشگاهی سالمونلا 16

1-2-10. پیشگیری و کنترل 19

1-2-11، ایمنی 19

1-2-12، درمان 19

1-3 – مروری بر روش های تایپینگ باکتری ها 20

1-3-1- اصول و مبانی روش MLVA 22

1-2-3- کلمات و اصطلاحات کاربردی در MLVA 24

1-3-3- مزایای MLVA نسبت به سایر روش های ژنوتایپنگ 26

1-4- اهداف پایان نامه 31

1-4-1- هدف علمی پایان نامه 31

1-4-2- اهداف جزئی 31

1-4-3- اهداف کاربردی 31

1-5- فرضیه ها 31

1-6- سئوالات 31

1-7- ضرورت انجام تحقیق 32

1-8- جنبه جدید بودن و نوآوری تحقیق 32

1-9- واژه نامه ها و اصطلاحات فنی 32

فصل دوم مروری بر ادبیات تحقیق و پیشینه تحقیق 34

بررسی متون: 35

فصل سوم :مواد وروشها 39

3-1-مواد و تجهیزات 40

3-1-1-دستگاه ها ووسایل مورد نیاز: 40

3-1-2-مواد مصرفی مورد نیاز: 41

3-1-3- محیطهای کشت مورد استفاده: 41

3-2-ترکیبات و محلولهای مورد نیاز و فرمول ساخت آنها 42

3-2-1-تهیه محلول(%25) SDS: 42

3-2-2- محلول EDTA(5/0 مولار): 42

3-2-3-تامپون لیز کننده سلول 42

3-2-4- تامپون TE حاوی RNase 42

3-2-5- بافر(5X)TBE: 42

3-2-7- محلول فنل-کلروفروم-ایزو آمیلیک الکل(PCI): 43

3-3- روش انجام طرح: 44

3-3-1- نوع مطالعه: 44

3-3-2-جامعه مورد مطالعه: 44

3-3-3- جمع آوری اطلاعات: 44

3-3-4- انجام امور باکتریولوژیک: 44

یک مطلب دیگر :

هیولاهای افسانه ای + عکس

3-4- ژنوتایپینگ ایزوله های سالمونلا با استفاده از روش MLVA 46

3-4-1- انجام آزمایش PCR جهت تکثیر لوکوس های VNTR 46

3-4-2- الکتروفورز محصولات VNTR 50

3-4-3- محاسبه ی اندازه و تعداد تکرار های VNTR 52

3-4-4-تجزیه و تحلیل داده های VNTR 52

فصل چهارم یافته ها 54

4-1- نمتایج حاصل از جمع آوری نمونه ها 55

4-2- نتایچ حاصل از استخراج ژنوم باکتریایی 57

4-3- نتایج حاصل از واکنش PCR جهت تکثیر لوکوس های VNTR 58

4-4- میزان تنوع الل های VNTR 74

4-5- آنالیز داده ها با استفاده از الگوریتم Minimum Spanning Tree 74

4-6- آنالیز داده های VNTR با استفاده از روش NJ 75

فصل پنجم :بحث ونتیجه گیری 77

5-1- بحث 78

5-2- نتیجه گیری و جمع بندی 91

منابع: 92

چکیده انگلسی 96

فهرست جداول و نمودارها

عنوان صفحه

جدول1-1، ویژگی های بیو شیمیایی سالمونلا 8

جدول 1-2، طبقه بندی نوین سالمونلا و میزان سروتایپ ها در زیر گونه ها 9

جدول 3-1، نام لوکوس ها و پرایمر های اختصاصی 47

جدول 3-2،مقادیرموردنیازجهت انجام واکنش هایPCRبرای تکثیرلوکوسهایVNTR 48

جدول 3-3، برنامه ریزی دستگاه ترموسایکلر جهت تکثیر لوکوس های SENTR2،

SENTR3 و SE-7 49

جدول3-4،برنامه ریزی دستگاهترموسایکلرجهت تکثیرلوکوسهایENTR6وSE-8 49

جدول 3-5، برنامه ریزی دستگاه ترموسایکلر برای تکثیر لوکوس SE-4 49

جدول 3-6، برنامه ریزی دستگاه ترموسایکلر جهت تکثیر لوکوس SE-10 50

جدول 3-7، برنامه ریزی دستگاه ترموسایکلر جهت تکثیر لوکوس SE-6 50

جدول 4-1، در فایل EXCEL 73

جدول 4-2، ضریب تنوع هانتر- گاتسون برای هر لوکوس محاسبه شده 74

نمودار 4-1، میزان فراوانی هر یک از سرو تایپ های سالمونلا در پژوهش حاضر 56

نمودار 4-2، میزان شیوع هر یک از سرو تایپ های سالمونلا در پژوهش حاضر 56

فهرست اشکال

عنوان صفحه

شکل 1-1 تصویر دکتر سالمون دامپزشک آمریکایی. 5

شکل1-2 باکتری سالمونلا 6

شکل 1-4مای شماتیک از VNTR ها 23

شکل 1-5 پروفایل اللی 24

شکل 1-6 آنالیز MLVA بوسیله MST 25

شکل 1-7، مزایای MLVA 26

شکل 1-8، مراحل انجام MLVA 27

شکل 4-1، میزان خلوص DNA نمونه ی شماره ی 53 57

شکل 4-2، میزان خلوص DNA نمونه ی شماره ی 24 57

شکل 4-3، لوکوس ENTR6 58

شکل 4-4، لوکوس SE4 59

شکل 4-5، لوکوس SE4 60

شکل 4-6، لوکوسSE6 61

شکل 4-7، لوکوس SE6 62

شکل 4-8، لوکوسSE7 63

شکل 4-9، لوکوسSE7 64

شکل 4-10، لوکوسSE8 65

شکل 4-11، لوکوسSE8 66

شکل 4-12، لوکوسSE10 67

شکل 4-13، لوکوسSE10 68

شکل 4-14، لوکوسSENTR2 69

شکل 4-15، لوکوسSENTR2 70

شکل 4-16، لوکوسSENTR3 71

شکل 4-17، لوکوسSENTR3 72

موضوعات: بدون موضوع لینک ثابت

فرم در حال بارگذاری ...

فید نظر برای این مطلب