نشانگر‌‌‌‌‌های مولکولی 11
2-10- توالی های تكرار شونده 15
2-11-مقایسه انواع مختلف نشانگر ‌‌‌‌های DNA 15
2-12- ریز ماهواره ها 17
2-12-1-سطح چند شكلی: 18
2-12-2-تکامل ریز ماهواره ها 18
2-12-3-مدل های جهش ریزماهواره ها 19
2-12-4-تشخیص ، فراوانی و توزیع ریز ماهواره ها در ژنوم 20
2-12-5-عمل ریز ماهواره ‌ها 21

2-12-6-مزیت‌‌‌‌‌ها و معایب ریز ماهواره‌‌‌‌‌ها 22
2-13-نشانگر ISSR 23
2-13-1-چند شکلی در ISSR: 23
2-13-3-مزایا و معایب نشانگر ISSR 24
2-14-مروری بر پژوهش‌‌‌‌‌های انجام شده روی تنوع ژنتیكی در پیاز 24
فصل سوم: مواد و روشها
3-1-تهیه نمونه‌ها 27
3-2-استخراج DNA ژنومی 29
3-3-تعیین کمیت و کیفیت DNA 30
3-4-آغازگر های SSR 31
3-4-1-بهینه سازی شرایط واکنش PCR برای آغازگر‌های مورد استفاده 33

یک مطلب دیگر :

3-4-2-انجام واکنش PCR با آغازگر های SSR 33
3-4-3-الکتروفورز محصول PCR روی ژل اکریل آمید (PAGE) 35
3-4-4-تفسیر ژل و تجزیه آماری داده ها 37
3-5-آغازگر های ISSR 38
3-5-1-بهینه سازی واکنش PCR برای آغازگر های ISSR 39
3-5-2-انجام واکنش PCR با آغازگر های ISSR 39
3-5-3-الکترفورز محصول PCR روی ژل آگارز 41
3-5-4-تفسیر و تجزیه آماری داده ها 41
فصل چهارم: نتایج و بحث
4-1-استخراج DNA ژنومی 42
4-2-نشانگر SSR 44
4-2-1-بهینه سازی شرایط واکنش PCR برای جفت آغازگر های SSR 44
4-2-2-الکترفورز محصول PCR روی ژل پلی اکریل آمید 44
4-2-3-نتایج حاصل از استفاده از نشانگر های SSR 45